Problematikou prevence HIV/AIDS se v ČR zabývá celá řada vládních i nevládních organizací. Na úrovni krajů řídí prevenci HIV/AIDS krajské hygienická stanice. Na celorepublikové úrovni zastřešuje problematiku Státní zdravotní ústav – Pracoviště manažerky Národního programu HIV/AIDS. Toto pracoviště také zastřešuje celostátní programy např. Evropský týden testování na HIV a žloutenky, celostátní primárně preventivní program pro školy: Hrou proti AIDS (2 jazykové verze, česká, ukrajinská). Stejně tak Státní zdravotní ústav provozuje celostátní bezplatnou telefonní linku: Národní linku pomoci AIDS. Další aktivity probíhají také na úrovni jednotlivých krajů ve spolupráci s neziskovými organizacemi a Zdravotními ústavy se sídlem v Ostravě a Ústí nad Labem.
